Ułatwienia dostępu

Wygłoszone seminaria

Seminarium z Fizyki Biologicznej i Bioinformatyki Online

Analysis of the physical nature of catalytic effects: Development and applications of bottom-up methods for/ab initio/ catalyst inverse design/via/ catalytic fields

14-02-2024 15:15 - 16:15
Miejsce
Zoom - Instytut Fizyki PAN, Warszawa
E-mail
Ten adres pocztowy jest chroniony przed spamowaniem. Aby go zobaczyć, konieczne jest włączenie w przeglądarce obsługi JavaScript.
Speaker
prof. W. Andrzej Sokalski
Affiliation
Department of Chemistry, Wrocław University of Science & Technology

Catalytic or inhibitory effects in proteins are governed by  intermolecular interactions. Analysis of the hierarchy of approximate theoretical models based on  well defined physical components permitted us to derive new nonempirical methods capable to determine key effects responsible for catalytic [1] activity. The dominant electrostatic nature of catalytic activity in enzymes  allowed us to derive static and dynamic catalytic fields, which have been used to predict mutation [2] or substitution [3] effects, explain extreme catalytic activity of  enzyme involving strong hydrogen bond chains [4] or to verify alternative reaction  mechanisms in enzymes [5].

Acknowledgments: NCN OPUS grant 2017/27/B/ST4/01327 „Catalytic fields as  the tool for theoretical analysis and design of biocatalysts"

Literature:
[1] W. Beker, W.A. Sokalski, J.Chem.Theor.Comp., 16 (2020) 3420-3429.
[2] W. Beker, M. van der Kamp, A. Mulholland, W.A. Sokalski,  J.Chem.Theor.Comp., 13(2017)945-955.
[3] M. Chojnacka, M. Feliks, W. Beker,W.A. Sokalski, J.Mol.Model., 24  (2018) 28.
[4] P. Kędzierski, M. Zaczkowska, W.A. Sokalski, J.Phys.Chem.B, 124  (2020)3661-3666.
[5] P. Kedzierski, M. Moskal, W. A. Sokalski, J.Phys.Chem.B, 125  (2021)11606-11616.

 
 

Lista terminów (Strona szczegółów wydarzenia)

  • 14-02-2024 15:15 - 16:15
Zapamiętaj ustawienia
Ustawienia plików cookies
Do działania oraz analizy naszej strony używamy plików cookies i podobnych technologii. Pomagają nam także zrozumieć w jaki sposób korzystasz z treści i funkcji witryny. Dzięki temu możemy nadal ulepszać i personalizować korzystanie z naszego serwisu. Zapewniamy, że Twoje dane są u nas bezpieczne. Nie przekazujemy ich firmom trzecim. Potwierdzając tę wiadomość akceptujesz naszą Politykę plików cookies.
Zaznacz wszystkie zgody
Odrzuć wszystko
Przeczytaj więcej
Essential
Te pliki cookie są potrzebne do prawidłowego działania witryny. Nie możesz ich wyłączyć.
Niezbędne pliki cookies
Te pliki cookie są konieczne do prawidłowego działania serwisu dlatego też nie można ich wyłączyć z tego poziomu, korzystanie z tych plików nie wiąże się z przetwarzaniem danych osobowych. W ustawieniach przeglądarki możliwe jest ich wyłączenie co może jednak zakłócić prawidłowe działanie serwisu.
Akceptuję
Analityczne pliki cookies
Te pliki cookie mają na celu w szczególności uzyskanie przez administratora serwisu wiedzy na temat statystyk dotyczących ruchu na stronie i źródła odwiedzin. Zazwyczaj zbieranie tych danych odbywa się anonimowo.
Google Analytics
Akceptuję
Odrzucam