|
Seminarium z fizyki biologicznej i bioinformatyki |
||
| Instytutu Biochemii i Biofizyki PAN, Instytutu Fizyki PAN i ICM UW odbywa sie raz na dwa tygodnie na zmiane w obu instytutach. | ||
|
Środa, 19 maja 2010, godz. 15:00 sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46 dr hab. Jarosław Poznański Badania strukturalne białek rozwiniętych
|
||
|
Środa, 5 maja 2010, godz. 15:00 sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A dr Paweł Szczęsny Trimeryczne adhezyny autotransportowe: relacje sekwencja-struktura w układach trimerycznych
|
||
|
Środa, 21 kwietnia 2010, godz. 15:00 sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46 prof. Jarosław Stolarski Ślady życia w kamieniu, czyli o wpływie organizmów na mineralizacje szkieletu
|
||
|
Środa, 7 kwietnia 2010, godz. 15:00 sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A prof. dr hab. Jan Antosiewicz Protonacyjne stopnie swobody w konformacyjnych przejściach białek indukowanych przez zmiany pH
|
||
|
Środa, 24 marca 2010, godz. 15:00 sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46 dr hab. Tomasz Lipniacki Aktywacja limfocytu B: równania reakcji-dyfuzji dla kaskady kinaz
|
||
|
Środa, 10 marca 2010, godz. 15:00 sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A prof. dr hab. Andrzej Koliński Wieloskalowe modelowanie białek
|
||
|
Środa, 24 lutego 2010, godz. 15:00 sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46 dr Maciej Długosz Symulacje dynamiki molekularnej N-terminalnych fragmentów huntingtyny. Konsekwencje dla agregacji.
|
||
|
Środa, 27 stycznia 2010, godz. 15:00 sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A prof. dr hab. Maciej Żylicz Udział białek opiekuńczych w zwijaniu się innych białek
|
||
|
Środa, 20 stycznia 2010, godz. 15:00 sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46 dr Agnieszka Chacińska Jak zbudować mitochondria?
|
||
|
Środa, 13 stycznia 2010, godz. 15:00 sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A dr Aleksandra Walczak Przetwarzanie informacji w małych układach regulujących ekspresję genów
|
||
|
Piątek, 18 grudnia 2009, godz. 11:00 Zakład Biofizyki Instytutu Fizyki Doświadczalnej, Wydziału Fizyki, UW ul. Zwirki i Wigury 93, sala nr 3091 dr Joanna I. Sułkowska Omijanie kryzysu w zwijaniu się białek z węzłami
|
||
|
Środa, 2 grudnia 2009, godz. 15:00 sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46 prof. Wiesław Nowak Komputerowe badania nanomechaniki biopolimerów - białka macierzy zewnątrzkomórkowej
|
||
|
Środa, 25 listopada 2009, godz. 15:00 sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A dr Thomas Weikl Folding, binding and adhesion: statistical-physical models of proteins
|
||
|
Środa, 18 listopada 2009, godz. 15:00 sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46 prof. Tomasz Kowalewski Mikroprzepływy: narzędzie diagnostyki i manipulacji w naukach biomedycznych
|
||
|
Środa, 28 października 2009, godz. 15:00 sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A dr Harald Janovjak Controlling membrane protein structure and function
|
||
|
Środa, 14 października 2009, godz. 15:00 sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46 dr Joanna Grzyb Białka projektowane de novo (makiety białkowe) w badaniach białek z centrami żelazo-siarkowymi i hemem
|
||
|
Środa, 30 września 2009, godz. 15:00 sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A dr Borys Wróbel Ewolucja sieci genowych regulujacych sztuczną embriogenezę w trójwymiarowej przestrzeni z symulowaną fizyką
|
||
|
Środa, 20 maja 2009, godz. 15:00 sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A Seminarium specjalne - dwa 35 minutowe referaty Dr Andriy Kryshtafovych CASP - A driving force in protein structure prediction
Dr Torgeir Hvidsten A systems biology approach to model the transcriptional network in trees
|
||
|
Środa, 13 maja 2009, godz. 15:00 sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46 dr Marcin Grynberg Aerolysins: a family update
|
||
|
Środa, 29 kwietnia 2009, godz. 15:00 sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A prof. Ryszard Stolarski Wielofunkcyjne białko CBC - dynamika wiązania końca 5' mRNA
|
||
|
Środa, 15 kwietnia 2009, godz. 15:00 sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46 dr hab. Sebastian Maćkowski Spektroskopia fluorescencyjna pojedyńczych kompleksów fotosyntetycznych
|
||
|
Środa, 1 kwietnia 2009, godz. 15:00 sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A dr Beata Kutrowska Green Fluorescent Protein (GFP) - Nagroda Nobla z Chemii 2008
|
||
|
Środa, 11 marca 2009, godz. 15:00 sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46 prof. Mirosław Dudek Nanocząstki magnetyczne w nano-biomateriałach
|
||
|
Środa, 4 marca 2009, godz. 15:00 sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A prof. Joanna Kufel Wszystkie RNA duże i małe
|
||
|
Środa, 25 lutego 2009, godz. 14:00 sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46 prof. Zofia Szweykowska-Kulińska Biogeneza roslinnych mikro-RNA i nowe aspekty regulacji ekspresji genów
|
||
|
Środa, 21 stycznia 2009, godz. 15:00 sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A mgr Julia Romanowska Własności miejsca wiążacego antybiotyki aminoklikozydowe w rybosomie
|
||
|
Środa, 14 stycznia 2009, godz. 15:00 sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46 dr Aleksandra Wysłouch-Cieszyńska S-nitrozylacja cystein - jedna z ważnych modyfikacji potranslacyjnych białek
|
||
|
Środa, 17 grudnia 2008, godz. 15:00 sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A mgr Zuzanna Szymańska Indukcja białek szoku termicznego i ich udział w inicjowaniu procesów nowotworowych
|
||
|
Środa, 3 grudnia 2008, godz. 15:00 sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46 dr Tadeusz Kosztolowicz Subdyfuzyjny model rozwoju prochnicy
|
||
|
Środa, 26 listopada 2008, godz. 15:00 sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A mgr inz. Rafał Biedrzycki Konstruktywna indukcja w zadaniu klasyfikacji sekwencji DNA
|
||
|
Środa, 12 listopada 2008, godz. 15:00 sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46 prof. dr hab. Teresa Zołądek Udział ligazy ubikwitynowej Rsp5/Nedd4 w transporcie białek i organizacji cytoszkieletu aktynowego u drożdży S. cerevisiae
|
||
|
Środa, 22 października 2008, godz. 15:00 sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A dr hab. Wojciech Dzwolak Chiralna bifurkacja - nowe zjawisko w misfoldingu i agregacji białek
|
||
|
Środa, 8 października 2008, godz. 15:00 sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46 dr hab. Paweł Pomorski Cytoszkielet a homeostaza wapniowa
|
||
|
Środa, 4 czerwca 2008, godz. 15:00 sala A, IBB, ul. Pawińskiego 5A Prof. Krzysztof Kuczera Simulation of peptide folding kinetics with milestoning
|
||
|
Środa, 14 maja 2008, godz. 15:00 sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A dr Anna Niedźwiecka (Instytut Fizyki PAN) Pare uwag o komunikacji konców 5' i 3' w metabolizmie eukariotycznego mRNA
|
||
|
Środa, 7 maja 2008, godz. 15:00 sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46 dr Radoslaw Przeniosło (Instytut Fizyki Doświadczalnej UW) Własności strukturalne i termiczne biogenicznego CaCo3 - badania szkieletów koralowców
|
||
|
Środa, 23 kwietnia 2008, godz. 15:00 sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A prof. dr hab. Marta Pasenkiewicz-Gierula (Wydział Biochemii, Biofizyki i Biotechnologii, UJ, Kraków) Jak białko kotwiczy sie w błonie
|
||
|
Środa, 9 kwietnia 2008, godz. 15:00 sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46 dr Jacek Jaworski (IIMCB, Warszawa) mTOR - wielofunkcyjna kinaza w układzie nerwowym
|
||
|
Środa, 26 marca 2008, godz. 15:00 sala A, IBB, ul. Pawińskiego 5A dr hab. Piotr Garstecki (Instytut Chemii Fizycznej, Warszawa) Dlaczego bakterie E. coli pływają prawą stroną?
|
||
|
Środa, 27 lutego 2008, godz. 15:00 sala A, IBB, ul. Pawińskiego 5A prof. Piotr Stępień (Instytut Biochemii i Biofizyki) Jeden gen wiele funkcji - opowieść o ludzkiej helikazie RNA
|
||
|
Środa, 20 lutego 2008, godz. 15:00 sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46 dr hab. Marek Tchórzewski (Wydział Biologii i Nauk o Ziemi, UMCS, Lublin) Struktura i funkcja elementów tworzących rybosomalne centrum GTPazowe
|
||
|
Środa, 23 stycznia 2008, godz. 15:00 sala A, IBB, ul. Pawińskiego 5A dr Sebastian Kmiecik (Wydział Chemii UW) Wielkoskalowe symulacje mechanizmów zwijania białek globularnych
|
||
|
Środa, 9 stycznia 2008, godz. 15:00 sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46 prof. Wojciech Rode (Instytut Biologii Doświadczalnej PAN) Modyfikacje potranslacyjne a właściwosci katalityczne i niekatalityczne
|
||
|
Środa, 19 grudnia 2007, godz. 15:00 sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A dr Maciej Długosz (ICM UW) Asocjacja antybiotyków aminoglikozydowych z rybosomalnym miejscem A. Symulacje dynamiki Brownowskiej.
|
||
|
Środa, 5 grudnia 2007, godz. 15:00 sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A dr Agnieszka Jabłonowska (IBB) Spektroskopia mas w badaniach struktury oligomerow peptydu Abeta związanego z chorobą Alzheimera
|
||
|
Środa, 28 listopada 2007, godz. 15:00 sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46 dr Anna Ajduk (Wydział Biologii, Uniwersytetu Warszawskiego) Aktywacja rozwoju zarodkowego ssaków
|
||
|
Środa, 14 listopada 2007, godz. 15:00 sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A dr Aleksandra Nowicka (Instytut Fizyki PAN) Identyfikacja genów cech ilościowych QTL (Quantitative Trait Loci) u jabłoni
|
||
|
Środa, 24 października 2007, godz. 15:00 sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46 dr Jerzy Pełka (Instytut Fizyki PAN) Promieniowanie synchrotronowe w biologii i medycynie
|
||
|
Środa, 17 października 2007, godz. 15:00 sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A mgr Szymon Niewieczerzał (Instytut Fizyki PAN) Stan przejściowy dla zwijania się białek w prostych modelach teoretycznych
|
||
|
Środa, 3 października 2007, godz. 15:00 sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46 mgr Izabela Rutkowska-Włodarczyk (Instytut Fizyki PAN) Spektrometria mas w proteomice: od proteomiki różnicowej i szukania biomarkerów do badania struktur białkowych
|
||
|
Wtorek, 18 września 2007, godz. 14:00 sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46 Prof. Roy L. Johnston (School of Chemistry, University of Birmingham, UK) Applications of Natural Computing to the Protein Folding Problem |
||
|
Poniedziałek, 21 maja 2007, godz. 10:00 sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46 mgr Grzegorz Chojnowski Silne i najsilniejsze sygnały w obrazach dyfrakcyjnych kryształów białek
|
||
|
Poniedziałek, 7 maja 2007, godz. 10:00 sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A prof. dr hab. Robert Holyst (Instytut Chemii Fizycznej PAN) Dyfuzja i lepkość w zatłoczonym środowisku od skali nano do skali makro
|
||
|
Poniedziałek, 16 kwietnia 2007, godz. 10:00 sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46 doc. dr hab. Dariusz Stepkowski (Instytut Biologii Doświadczalnej PAN) Rozważania teoretyczne na temat amyldoidogenezy białka prionowego
|
||
|
Poniedziałek, 2 kwietnia 2007, godz. 10:00 sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A dr Anna Gambin (Instytut Informatyki Uniwersytetu Warszawskiego) Stochastyczne modelowanie w analizie danych proteomicznych
|
||
|
Poniedziałek, 26 marca 2007, godz. 10:00 sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46 doc. dr hab. Krystyna Kolwas (Instytut Fizyki PAN) Światło jako narzędzie w badaniach przemian energetycznych w mitochondriach plemnikowych
|
||
|
Poniedziałek, 19 marca 2007, godz. 10:00 sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46 dr Aleksandra Nowicka (Instytut Fizyki PAN) Tablice częstości podstawień aminokwasowych PAM w kontekście analiz filogenetycznych genomów bakteryjnych
|
||
|
Poniedziałek, 12 marca 2007, godz. 10:00 sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46 dr Paweł Daniluk (CD Bioexploratorium, Wydział Fizyki UW) Lokalne deskryptory struktur białkowych. Wprowadzenie teoretyczne oraz zastosowania do analizy i przewidywania struktury
|
||
|
Poniedziałek, 19 lutego 2007, godz. 10:00 sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A dr Krzysztof Pawłowski (Instytut Biologii Doświadczalnej PAN) Zastosowania bioinformatyki w przemyśle faramceutycznym - poszukiwanie nowych genów docelowych dla leków
|
||
|
Poniedziałek, 22 stycznia 2007, godz. 10:00 sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46 dr Agnieszka Podlaska (IBB PAN) Rola proteasomu w odpowiedzi komórek eukariotycznych na uszkodzenia DNA
|
||
|
Poniedziałek, 8 stycznia 2007, godz. 10:00 sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A prof. Danek Elbaum (Instytut Biologii Doświadczalnej PAN) Mechanizmy toksyczności beta-amyloidu
|
||
|
Poniedziałek, 18 grudnia 2006, godz. 10:00 sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46 dr Antoni Zwiefka (Instytut Immunologii i Terapii Doświadczalnej PAN, Wrocław) Metoda selekcji bibliotek fagowych w badaniach struktury i funkcji białek
|
||
|
Poniedziałek, 11 grudnia 2006, godz. 10:00 sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46 dr Dorota Szczepankowska (Instytut Biologii Doświadczalnej PAN) Wpływ palmitoilokarmityny na zmiany struktury błony komórkowej
|
||
|
Poniedziałek, 4 grudnia 2006, godz. 10:00 sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A dr Wojciech Karlowski (UAM Poznań) Greenformatics: wybrane metody poznania i analizy genomów roślinnych
|
||
|
Poniedziałek, 13 listopada 2006, godz. 10:00 sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46 dr inż. Justyna Barańska (Instytut Fizyki, Politechnika Poznańska) Ewolucja konformacji i parametrów węzłów zaciskanych na idealnej linie
|
||
|
Poniedziałek, 6 listopada 2006, godz. 10:00 sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A mgr. Michał Boniecki (Wydział Chemii UW) Ciągły i pośredniej rozdzielczości model białka - Refiner: konstrukcja i zastosowania
|
||
|
Poniedziałek, 16 października 2006, godz. 10:00 sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46 Dr Michał Wojciechowski (Instytut Fizyki PAN) Wpływ ciśnienia na oddziaływania wewnątrzcząsteczkowe w ramach gruboziarnistych modeli Go
|
||
|
Poniedziałek, 2 października 2006, godz. 10:00 sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46 Dr Piotr Szymczak (Instytut Fizyki Teoretycznej Uniwersytetu Warszawskiego) Rozciąganie i zwijanie białek pod wpływem stałej siły
|
||
|
Poniedziałek, 22 maja 2006, godz. 10:00 sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46 Dr Dominik Gront (Wydział Chemii Uniwersytetu Warszawskiego) Wybrane aspekty modelowania białek w zredukowanej przestrzeni konformacyjnej
|
||
|
Poniedziałek, 24 kwietnia 2006, godz. 10:00 sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A mgr Bartosz Różycki (IT UW) Adhezja błon z aktywnymi składnikami
|
||
|
Poniedziałek, 03 kwietnia 2006, godz. 10:00 sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46 Dr hab. Andrzej Kloczkowski (Iowa State University) Przewidywanie struktury drugorzędowej białek
|
||
|
Seminarium specjalne Czwartek, 23 marca 2006, godz. 14:00 sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46 Dr. TOBIAS HENZLER (Bio-Logic - Science Instruments SA, F-38640 Claix, France) Introduction to the Stopped-flow Technique - Principles and Instrumentation
|
||
|
Poniedziałek, 20 marca 2006, godz. 10:00 sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A dr Joanna Trylska (ICM UW) Właściwości elektrostatyczne i dynamika rybosomu bakteryjnego
|
||
|
Poniedziałek, 27 lutego 2006, godz. 10:00 sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46 dr Michał Wojciechowski (Instytut Fizyki PAN) Uogólniony model Borna - zalety i wady uproszczonego rozwiązywania Poissona-Boltzmanna
|
||
|
Poniedziałek, 20 lutego 2006, godz. 10:00 sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A dr Tomasz Lipniacki (IPPT PAN) Stochastyczna regulacja wczesnej odpowiedzi immunologicznej: Model NF-kappaB
|
||
|
Poniedziałek, 16 stycznia 2006, godz. 10:00 sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46 Jan Karbowski (California Institute of Technology) Fizyczne i biologiczne zasady funkcjonowania mozgu: od robakow C Elegans do ssakow
|
||
|
Poniedziałek, 09 stycznia 2006, godz. 10:00 sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A dr Barbara Wawro (Instytut Biologii Doswiadczalnej PAN i University of Medicine and Dentistry of New Jersey, USA) Regulacja polimeryzacji aktyn w komórkach: forminy
|
||
|
Poniedziałek, 19 grudnia 2005, godz. 10:00 sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46 Bertrand Vileno (Institute of Physics of Complex Matter, Ecole Polytechnique Federale de Lausanne (EPFL)) From carbon and semiconductor nanostructures to biological targets - photo-oxidative stress
|
||
|
Poniedziałek, 14 listopada 2005, godz. 10:00 sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46 mgr Szymon Niewieczerzal (Instytut Fizyki PAN) Symulacje procesów asocjacji guaniny z fosforylazą nukleozydów purynowych metodami dynamiki brownowskiej
|
||
|
Poniedziałek, 24 października 2005, godz. 10:00 sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A dr Valentina Tozzini (NEST CNR-INFM i Scuola Normale Superiore, Piza, Wlochy) Coarse-grained models for large time-scale molecular dynamics simulations
|
||
|
Poniedziałek, 17 października 2005, godz. 10:00 sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46 Dr Piotr Pawłowski (Instytut Biochemii i Biofizyki PAN) Od retikulocytu do erytrocytu
|
||
|
Poniedziałek, 3 października 2005, godz. 10:00 sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A Prof. Marek Cieplak (Instytut Fizyki PAN) Stan przejściowy w zwijaniu się białek - model ścisły
|
||
|
Poniedzialek, 9 maja 2005, godz. 10:00 sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A Dr Wojciech Dzwolak (Instytut Fizyki Wysokich Cisnień PAN) O amyloidogenezie, czyli o molekularnej socjopatii białek |
||
|